خلال عودتها من المدرسة في أحد الأيام، تُنجد كونوها كوغا فتاة تُدعى ساتوكو كوساغاكوري، والتي يتضح أنها نينجا هاربة من قريتها. لا يلبث ملاحقون من قرية ساتوكو أن يظهروا بحثاً عنها، لكن كونوها تتصدى لهم بمهارة فائقة. يتضح أن هذه الطالبة الثانوية، التي تبدو طبيعية للغاية، هي في الواقع قاتلة محترفة. وهكذا، تنشأ حياة مشتركة قد تكون محفوفة بالمخاطر بين هاتين الشخصيتين: النينجا والقاتلة المحترفة.
